護根靈與化學殺蟲劑、除草劑混合使用，但不能和化學殺菌劑消毒劑混用。它們之間不能混合使用，這兩類農藥的連續使用應間隔5天左右，如果先使用化學殺菌劑，要等藥效完全消失后，方能再使用微生物農藥護根靈；反之，也應這樣要求。只有這樣，才能保證這兩種藥劑都能達到有效地防治目的。